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8周解析SARM1蛋白結構

8周解析SARM1蛋白結構

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  • SARM1具顯著的動態構象變化,體外難以穩定并捕捉其激活態構象;
  • 目前的候選藥物分子主要為競爭性抑制劑,缺乏明確的抑制機制。
  • 通過晶泰科技AI驅動的Cryo-EM圖像處理模塊,幫助加速解析抑制劑與SARM1的高分辨率電鏡結構,為理性藥物設計提供新思路、新方向;
  • 進一步揭示該靶點的自抑制態與激活態的轉換機制,加深對靶點作用機理的理解。
圖1 SARM1 與抑制劑的 2.8 ? 電鏡密度圖

表1 高精度結構模型驗證
圖2 抑制劑 -ADPR 幫助鎖定 SARM1 處于激活態構象
(綠色:SARM1-TIR(A),青色:SARM1-TIR(B),紅色:抑制劑-ADPR )

僅使用200kV電鏡,在8 周內成功解析SARM1與抑制劑的2.8 ?結構,這項開創性研究成果揭示了一種小分子抑制劑的競爭性抑制機制。高比例NMN/NAD+誘導激活SARM1,抑制劑在SARM1催化下與NAD+發生堿基交換反應,生成抑制劑-ADPR這一新產物,該產物與SARM1結合并鎖定其處于激活態構象,封鎖底物NAD+結合口袋,從而抑制SARM1的NAD+降解活性。該結果為證實SARM1的激活機制和堿基交換反應提供了最直接的結構證據。

數據計算過程中,通過使用 AI 驅動的圖像處理模塊實現了目標顆粒的精確挑選,與經典方法相比,在同等算力下,加速整體計算流程并實現更高的分辨率。

同時,首次從分子水平揭示了 SARM1 的激活機制,加深對其如何介導退行性疾病發生機理的理解。

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