晶泰科技的抗體發現平臺XupremAb?將濕實驗的優勢與前沿的AI技術有機結合
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結合AI和濕實驗的優勢
AI是一項非常強大的技術,但在結合濕實驗后,才可以發揮出最大效用。我們已經建立了功能完善的抗體發現實驗室,并擁有一支由AI科學家和實驗生物學家組成的跨學科團隊。這種協同作用可帶來許多新的技術可能性,僅靠濕實驗或計算都是無法做到的。
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擴大搜索空間,獲得更高質量的苗頭抗體
在一開始就擁有盡可能多的多樣化、高質量苗頭分子可為抗體藥物發現奠定堅實基礎。我們利用AI提升現有實驗方法,或者通過AI擴大苗頭抗體的搜索空間。
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利用AI提高抗體工程效率,實現多目標優化
我們希望減少抗體工程中的不確定性和隨機突變方法。AI可以幫助我們探索更廣闊的突變空間,并在選擇候選分子時將多項性質同時納入考量。
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將優良的可開發性注入每個分子
可開發性是我們在發現階段需要評估的一項重要性質。通過結合體外實驗和計算方法,我們能夠以超高通量和更低的成本評估可開發性。
XupremAb?是一站式的抗體發現解決方案,整個過程均融入了AI技術。該平臺既可作為完整的解決方案,涵蓋從靶點到臨床前候選分子的整個流程,也可作為單獨的子平臺對外提供合作機會。
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抗體篩選
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XtraDoma?
AI驅動的雜交瘤平臺,放大所得先導抗體數量
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NGS+AI挖掘免疫組庫,超高通量篩選抗體
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XpeedPlay?
學習多物種天然抗體序列特征的模型算法融合噬菌體展示技術,超高速獲得苗頭抗體
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XuperNovo?
虛擬篩選,從頭設計抗體
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新一代人源化小鼠平臺
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案例
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擴大搜索空間,獲得更高質量的苗頭抗體
案例 1 :對免疫組庫中數百萬個抗體序列進行虛擬篩選
利用XploreSeq? 對數百萬個BCR進行NGS測序,識別出高置信度的苗頭抗體 (左圖)。
在該項目中,XploreSeq? 共預測了717個結合抗體,從中隨機選擇48個用于表達和檢測。其中66.7% (32/48)被確認為結合抗體,只有18.6%(6/32)的結合抗體與雜交瘤篩選的苗頭抗體重疊(右圖)。
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利用AI提高抗體工程效率,實現多目標優化
案例2: 先導抗體的雙向親和力改造
目標:分別提高和降低先導抗體的親和力,為雙特異性抗體開發提供更多選擇。
我們的AI模型生成了3組突變體,其預測親和力相比野生型:
1) 顯著提高 (目標:10倍)
2) 稍微提高 (目標:3倍)
3) 稍微降低 (目標:降低3倍)
表達和測試時,這些突變體顯示出與其目標范圍相吻合的親和力(如左圖所示)。
對96個突變體進行了1輪設計-合成-測試,獲得一組高度優化的先導分子,其KD跨度為3個數量級,具有優良的可開發性。
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將優良的可開發性注入每個分子
案例 3 :XcelDev? Silico根據可開發性對30多種候選抗體進行評估和排序
利用XcelDev? Silico分析了36個通過了結合和功能篩選的苗頭抗體。我們預測了每種抗體的6種性質,并在0-1的范圍進行評分(以顏色梯度顯示)。
我們計算了整體可開發性得分,對所有36個苗頭抗體進行排序。對前7個苗頭抗體(紅色方框)進行了達以及一系列體外可開發性測定,以驗證排序的有效性。所有7個苗頭抗體的測定結果均良好,Tm、SEC、AC-SINS和HIC結果如下圖所示。
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36種抗體的XcelDev? Silico結果
前7位候選抗體的濕實驗驗證結果
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